Les personnages "neutres" sont ce qui sont un peu comme "uniques". C'est à dire qu'ils n'appartiennent à aucune faction (armée des Enfers, armée de Palutena...).
Les Neutres sont :
-Magnus,
-Pit maléfique,
-Poséidon,
-Phénix, l'immortel,
-La grène d'exosment,
-l'Aurige,
-le Dévoreur d'âmes,
-Dyntos,
-Pseudo-Palutena.